西南大学农业科学研究院成立于2017年3月，为校管直属科研机构，是按国家重点实验室标准高起点、高标准、高要求建设的创新性、开放性、竞争性和综合性的大型公共研究平台，也是学校农业学科高层次人才引进和培育的平台。研究院主要以植物（农作物为主）为研究对象，重点开展基础和应用基础层面的原创性研究工作。农业科学研究院依托隆平楼，搭建仪器设备共享服务公共平台，占地1122平米，目前平台有各类仪器设备127台，总价值达3250余万元，其中大型设备有20台套。

研究院从全校涉农的院、所、中心等遴选出9个研究团队，设立作物种质资源创新与利用、植物发育与调控、植物病虫害生物学三个研究中心和一个大型仪器服务共享平台。学科涵盖作物学、园艺学、植物保护、生物学、农业资源与环境5个一级学科。研究院现有专兼职人员72名， 94%具有高级职称，80%具有海外留学经历，入选国家级人才项目10名，省市级3人才计划12名。拥有科技部“作物重要性状基因功能解析及应用创新团队”、教育部“柑橘主要病虫害持续控制基础研究创新团队”和首批“全国高校黄大年式教师团队”。

研究院成立以来，新增国家重点研发计划项目8项（含2项青年科学家项目），国家自然基金委重点项目3项、国际合作交流重点项目1项、区域发展创新联合基金2项，面上项目和青年基金66项，公益性行业专项和国家支撑项目近40项，平均每年新增纵向经费超过5000万元。获教育部科技进步一等奖1项、重庆市科技进步一等奖2项、自然科学奖一等奖1项，获授权发明专利99项，平均每年在Nature Communications、Nature Plants、Plant Cell、PNAS等高水平刊物发表论文100余篇。近年，农科院各团队根植农村， 新品种、新技术的推广应用，农民增收增效显著。

（更新于2025年5月）